Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP4BP1P59074 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4BP1P59074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms