Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP3P57721 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms