Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF3P57682 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF3P57682 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF3P57682 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF3P57682 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF3P57682 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF3P57682 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF3P57682 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF3P57682 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF3P57682 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF3P57682 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF3P57682 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF3P57682 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF3P57682 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF3P57682 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF3P57682 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF3P57682 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF3P57682 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF3P57682 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF3P57682 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF3P57682 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF3P57682 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF3P57682 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF3P57682 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF3P57682 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF3P57682 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF3P57682 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF3P57682 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF3P57682 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF3P57682 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF3P57682 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF3P57682 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms