Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH13P55290 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH13P55290 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH13P55290 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH13P55290 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH13P55290 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH13P55290 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH13P55290 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH13P55290 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH13P55290 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH13P55290 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH13P55290 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH13P55290 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH13P55290 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH13P55290 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH13P55290 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH13P55290 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH13P55290 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH13P55290 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH13P55290 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH13P55290 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH13P55290 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH13P55290 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH13P55290 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH13P55290 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH13P55290 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms