Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP9P55211 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP9P55211 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP9P55211 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP9P55211 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP9P55211 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP9P55211 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP9P55211 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP9P55211 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP9P55211 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP9P55211 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP9P55211 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP9P55211 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP9P55211 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP9P55211 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP9P55211 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP9P55211 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP9P55211 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP9P55211 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP9P55211 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP9P55211 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP9P55211 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP9P55211 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP9P55211 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASP9P55211 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP9P55211 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP9P55211 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP9P55211 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms