Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTTPP55157 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTTPP55157 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTTPP55157 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTTPP55157 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTTPP55157 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTTPP55157 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTTPP55157 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTTPP55157 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTTPP55157 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTTPP55157 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTTPP55157 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTTPP55157 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTTPP55157 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTTPP55157 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTTPP55157 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTTPP55157 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTTPP55157 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTTPP55157 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MTTPP55157 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTTPP55157 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTTPP55157 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTTPP55157 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTTPP55157 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTTPP55157 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTTPP55157 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTTPP55157 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTTPP55157 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTTPP55157 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms