Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YARSP54577 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YARSP54577 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YARSP54577 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YARSP54577 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YARSP54577 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YARSP54577 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
YARSP54577 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YARSP54577 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YARSP54577 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YARSP54577 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YARSP54577 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YARSP54577 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YARSP54577 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YARSP54577 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YARSP54577 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
YARSP54577 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YARSP54577 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YARSP54577 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
YARSP54577 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
YARSP54577 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YARSP54577 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YARSP54577 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YARSP54577 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YARSP54577 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YARSP54577 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
YARSP54577 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YARSP54577 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YARSP54577 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YARSP54577 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YARSP54577 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YARSP54577 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YARSP54577 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YARSP54577 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YARSP54577 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YARSP54577 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YARSP54577 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YARSP54577 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YARSP54577 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YARSP54577 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YARSP54577 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YARSP54577 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YARSP54577 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YARSP54577 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YARSP54577 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YARSP54577 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YARSP54577 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YARSP54577 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YARSP54577 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YARSP54577 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms