Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK2P53671 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms