Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLCSP50747 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLCSP50747 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLCSP50747 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLCSP50747 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLCSP50747 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLCSP50747 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLCSP50747 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLCSP50747 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLCSP50747 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLCSP50747 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLCSP50747 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLCSP50747 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLCSP50747 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLCSP50747 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLCSP50747 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLCSP50747 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLCSP50747 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLCSP50747 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLCSP50747 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLCSP50747 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLCSP50747 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLCSP50747 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLCSP50747 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLCSP50747 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLCSP50747 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLCSP50747 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLCSP50747 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLCSP50747 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLCSP50747 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLCSP50747 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLCSP50747 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLCSP50747 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLCSP50747 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLCSP50747 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms