Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX2P50458 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX2P50458 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX2P50458 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX2P50458 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX2P50458 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LHX2P50458 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX2P50458 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX2P50458 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX2P50458 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX2P50458 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX2P50458 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX2P50458 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX2P50458 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHX2P50458 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX2P50458 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX2P50458 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX2P50458 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX2P50458 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX2P50458 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX2P50458 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX2P50458 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX2P50458 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX2P50458 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX2P50458 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX2P50458 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX2P50458 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX2P50458 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX2P50458 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX2P50458 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX2P50458 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX2P50458 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX2P50458 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX2P50458 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX2P50458 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX2P50458 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX2P50458 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX2P50458 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX2P50458 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms