Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms