Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC1P48995 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms