Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRIP1P48552 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms