Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA8P48165 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA8P48165 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA8P48165 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA8P48165 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA8P48165 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA8P48165 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA8P48165 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA8P48165 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA8P48165 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA8P48165 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA8P48165 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA8P48165 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA8P48165 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA8P48165 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA8P48165 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA8P48165 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA8P48165 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA8P48165 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA8P48165 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA8P48165 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA8P48165 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA8P48165 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA8P48165 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA8P48165 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA8P48165 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA8P48165 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA8P48165 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA8P48165 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA8P48165 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA8P48165 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA8P48165 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA8P48165 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA8P48165 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA8P48165 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA8P48165 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA8P48165 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA8P48165 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA8P48165 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA8P48165 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA8P48165 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA8P48165 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA8P48165 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA8P48165 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA8P48165 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA8P48165 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA8P48165 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA8P48165 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA8P48165 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA8P48165 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA8P48165 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms