Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms