Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD52P43351 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD52P43351 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD52P43351 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD52P43351 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD52P43351 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD52P43351 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD52P43351 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD52P43351 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD52P43351 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD52P43351 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD52P43351 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD52P43351 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD52P43351 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD52P43351 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD52P43351 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD52P43351 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD52P43351 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD52P43351 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD52P43351 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD52P43351 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD52P43351 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms