Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSKP43235 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSKP43235 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSKP43235 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSKP43235 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSKP43235 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSKP43235 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSKP43235 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSKP43235 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSKP43235 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSKP43235 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSKP43235 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSKP43235 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSKP43235 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSKP43235 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSKP43235 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSKP43235 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSKP43235 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSKP43235 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTSKP43235 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSKP43235 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSKP43235 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSKP43235 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSKP43235 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSKP43235 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSKP43235 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSKP43235 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSKP43235 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSKP43235 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSKP43235 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSKP43235 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSKP43235 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSKP43235 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSKP43235 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSKP43235 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms