Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCAMP43121 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCAMP43121 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCAMP43121 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCAMP43121 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCAMP43121 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCAMP43121 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCAMP43121 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCAMP43121 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MCAMP43121 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCAMP43121 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCAMP43121 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCAMP43121 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCAMP43121 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCAMP43121 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCAMP43121 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCAMP43121 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCAMP43121 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCAMP43121 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCAMP43121 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCAMP43121 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCAMP43121 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCAMP43121 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCAMP43121 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCAMP43121 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MCAMP43121 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCAMP43121 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCAMP43121 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCAMP43121 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCAMP43121 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCAMP43121 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCAMP43121 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MCAMP43121 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCAMP43121 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCAMP43121 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCAMP43121 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCAMP43121 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCAMP43121 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCAMP43121 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCAMP43121 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCAMP43121 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCAMP43121 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCAMP43121 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCAMP43121 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCAMP43121 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MCAMP43121 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCAMP43121 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCAMP43121 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCAMP43121 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCAMP43121 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCAMP43121 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCAMP43121 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCAMP43121 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCAMP43121 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCAMP43121 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCAMP43121 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCAMP43121 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCAMP43121 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCAMP43121 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCAMP43121 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MCAMP43121 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCAMP43121 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCAMP43121 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCAMP43121 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCAMP43121 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCAMP43121 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCAMP43121 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCAMP43121 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCAMP43121 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCAMP43121 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCAMP43121 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCAMP43121 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCAMP43121 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCAMP43121 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCAMP43121 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms