Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP2P42575 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP2P42575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP2P42575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP2P42575 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP2P42575 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP2P42575 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP2P42575 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP2P42575 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP2P42575 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP2P42575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP2P42575 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP2P42575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP2P42575 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP2P42575 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP2P42575 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP2P42575 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP2P42575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP2P42575 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP2P42575 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP2P42575 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP2P42575 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP2P42575 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP2P42575 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP2P42575 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP2P42575 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP2P42575 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP2P42575 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP2P42575 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP2P42575 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP2P42575 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP2P42575 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP2P42575 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP2P42575 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP2P42575 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP2P42575 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP2P42575 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP2P42575 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP2P42575 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP2P42575 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP2P42575 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP2P42575 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CASP2P42575 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP2P42575 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP2P42575 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms