Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP3P42574 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP3P42574 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP3P42574 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP3P42574 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP3P42574 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP3P42574 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP3P42574 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP3P42574 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP3P42574 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP3P42574 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP3P42574 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP3P42574 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP3P42574 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP3P42574 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP3P42574 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP3P42574 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP3P42574 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP3P42574 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP3P42574 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP3P42574 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP3P42574 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP3P42574 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP3P42574 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP3P42574 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms