Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC26A3P40879 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms