Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM23P36406 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM23P36406 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms