Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms