Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RBP32927 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RBP32927 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms