Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR1P32246 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR1P32246 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR1P32246 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR1P32246 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR1P32246 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR1P32246 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR1P32246 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR1P32246 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR1P32246 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR1P32246 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR1P32246 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR1P32246 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR1P32246 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR1P32246 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR1P32246 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR1P32246 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR1P32246 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR1P32246 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR1P32246 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR1P32246 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR1P32246 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR1P32246 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR1P32246 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR1P32246 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR1P32246 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR1P32246 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR1P32246 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR1P32246 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR1P32246 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR1P32246 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR1P32246 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR1P32246 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR1P32246 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR1P32246 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR1P32246 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR1P32246 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR1P32246 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR1P32246 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR1P32246 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR1P32246 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR1P32246 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms