Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH4A1P30038 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH4A1P30038 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH4A1P30038 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH4A1P30038 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms