Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBMS1P29558 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms