Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRMP28827 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRMP28827 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRMP28827 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
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