Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5F1P24539 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms