Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CD9P21926 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD9P21926 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD9P21926 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD9P21926 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD9P21926 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD9P21926 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD9P21926 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD9P21926 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD9P21926 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD9P21926 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD9P21926 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD9P21926 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD9P21926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD9P21926 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD9P21926 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD9P21926 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD9P21926 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD9P21926 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD9P21926 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD9P21926 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD9P21926 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD9P21926 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD9P21926 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD9P21926 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD9P21926 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD9P21926 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD9P21926 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD9P21926 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD9P21926 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD9P21926 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD9P21926 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD9P21926 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD9P21926 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD9P21926 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD9P21926 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD9P21926 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD9P21926 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD9P21926 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD9P21926 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD9P21926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD9P21926 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD9P21926 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD9P21926 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD9P21926 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD9P21926 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD9P21926 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD9P21926 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD9P21926 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD9P21926 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD9P21926 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD9P21926 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD9P21926 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD9P21926 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD9P21926 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD9P21926 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms