Protein–RNA interactions for Protein: P21854

CD72, B-cell differentiation antigen CD72, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD72P21854 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD72P21854 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD72P21854 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD72P21854 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD72P21854 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD72P21854 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD72P21854 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD72P21854 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD72P21854 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD72P21854 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD72P21854 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD72P21854 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD72P21854 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD72P21854 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD72P21854 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD72P21854 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD72P21854 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD72P21854 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD72P21854 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD72P21854 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD72P21854 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD72P21854 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD72P21854 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD72P21854 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD72P21854 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD72P21854 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD72P21854 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD72P21854 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD72P21854 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD72P21854 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD72P21854 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD72P21854 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD72P21854 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD72P21854 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD72P21854 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD72P21854 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD72P21854 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD72P21854 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD72P21854 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD72P21854 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD72P21854 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD72P21854 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD72P21854 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD72P21854 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD72P21854 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD72P21854 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD72P21854 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD72P21854 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms