Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms