Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA2P20248 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms