Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD53P19397 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD53P19397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD53P19397 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD53P19397 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD53P19397 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD53P19397 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD53P19397 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD53P19397 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD53P19397 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD53P19397 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD53P19397 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD53P19397 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD53P19397 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD53P19397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD53P19397 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD53P19397 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD53P19397 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD53P19397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD53P19397 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD53P19397 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD53P19397 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD53P19397 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD53P19397 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD53P19397 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD53P19397 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD53P19397 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD53P19397 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD53P19397 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD53P19397 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD53P19397 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD53P19397 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD53P19397 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD53P19397 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD53P19397 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms