Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VCAM1P19320 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCAM1P19320 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VCAM1P19320 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VCAM1P19320 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VCAM1P19320 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VCAM1P19320 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VCAM1P19320 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VCAM1P19320 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VCAM1P19320 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VCAM1P19320 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCAM1P19320 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCAM1P19320 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCAM1P19320 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCAM1P19320 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VCAM1P19320 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VCAM1P19320 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms