Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH2P19022 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH2P19022 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH2P19022 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH2P19022 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH2P19022 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH2P19022 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH2P19022 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH2P19022 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH2P19022 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH2P19022 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH2P19022 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH2P19022 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH2P19022 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH2P19022 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH2P19022 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH2P19022 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH2P19022 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH2P19022 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH2P19022 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH2P19022 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH2P19022 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH2P19022 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH2P19022 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH2P19022 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms