Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN2P17655 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN2P17655 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms