Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CD44P16070 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD44P16070 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CD44P16070 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD44P16070 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD44P16070 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD44P16070 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD44P16070 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD44P16070 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD44P16070 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD44P16070 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD44P16070 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD44P16070 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CD44P16070 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD44P16070 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD44P16070 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD44P16070 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD44P16070 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD44P16070 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD44P16070 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD44P16070 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD44P16070 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD44P16070 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD44P16070 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD44P16070 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD44P16070 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD44P16070 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD44P16070 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD44P16070 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD44P16070 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD44P16070 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD44P16070 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CD44P16070 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD44P16070 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD44P16070 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD44P16070 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms