Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA1P14867 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms