Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARGP13631 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARGP13631 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARGP13631 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARGP13631 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARGP13631 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARGP13631 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARGP13631 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARGP13631 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARGP13631 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARGP13631 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARGP13631 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARGP13631 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARGP13631 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARGP13631 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARGP13631 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARGP13631 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARGP13631 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARGP13631 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARGP13631 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RARGP13631 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARGP13631 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARGP13631 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARGP13631 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARGP13631 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARGP13631 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARGP13631 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARGP13631 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARGP13631 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARGP13631 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RARGP13631 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARGP13631 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARGP13631 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARGP13631 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARGP13631 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARGP13631 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARGP13631 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARGP13631 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARGP13631 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RARGP13631 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARGP13631 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARGP13631 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARGP13631 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARGP13631 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RARGP13631 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARGP13631 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARGP13631 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARGP13631 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARGP13631 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARGP13631 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARGP13631 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RARGP13631 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARGP13631 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARGP13631 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARGP13631 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARGP13631 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARGP13631 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARGP13631 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARGP13631 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARGP13631 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARGP13631 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARGP13631 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms