Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA4P13612 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA4P13612 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms