Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40ALP0C0E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40ALP0C0E4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms