Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA5P08648 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA5P08648 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms