Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPB2P08579 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms