Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRAP08240 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRAP08240 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms