Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1P05023 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A1P05023 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms