Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYCNP04198 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYCNP04198 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MYCNP04198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYCNP04198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYCNP04198 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYCNP04198 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYCNP04198 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYCNP04198 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYCNP04198 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYCNP04198 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYCNP04198 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYCNP04198 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYCNP04198 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MYCNP04198 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYCNP04198 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYCNP04198 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCNP04198 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCNP04198 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCNP04198 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCNP04198 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCNP04198 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYCNP04198 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYCNP04198 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCNP04198 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYCNP04198 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYCNP04198 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYCNP04198 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYCNP04198 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYCNP04198 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYCNP04198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYCNP04198 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYCNP04198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYCNP04198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCNP04198 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYCNP04198 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYCNP04198 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYCNP04198 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYCNP04198 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYCNP04198 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCNP04198 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms