Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGHV3-33P01772 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-33P01772 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms