Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTCP00480 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTCP00480 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTCP00480 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTCP00480 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTCP00480 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTCP00480 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTCP00480 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTCP00480 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTCP00480 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTCP00480 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTCP00480 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTCP00480 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTCP00480 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTCP00480 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTCP00480 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTCP00480 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTCP00480 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTCP00480 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTCP00480 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTCP00480 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTCP00480 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTCP00480 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTCP00480 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTCP00480 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTCP00480 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTCP00480 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTCP00480 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms