Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GGPS1O95749 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GGPS1O95749 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGPS1O95749 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms